Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nop58Q6DFW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nop58Q6DFW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nop58Q6DFW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms