Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cep170Q6A065 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cep170Q6A065 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cep170Q6A065 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cep170Q6A065 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms