Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PnkdQ69ZP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PnkdQ69ZP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms