Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sptbn2Q68FG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sptbn2Q68FG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sptbn2Q68FG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms