Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc8eQ66JT1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms