Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprjQ64455 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtprjQ64455 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprjQ64455 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprjQ64455 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprjQ64455 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprjQ64455 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprjQ64455 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprjQ64455 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprjQ64455 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprjQ64455 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprjQ64455 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprjQ64455 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprjQ64455 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtprjQ64455 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms