Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf4Q64310 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms