Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh2Q64221 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms