Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa13Q62424 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa13Q62424 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms