Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl12Q62401 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl12Q62401 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms