Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tff3Q62395 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff3Q62395 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms