Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrhQ62361 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrhQ62361 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TrhQ62361 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TrhQ62361 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrhQ62361 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrhQ62361 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TrhQ62361 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrhQ62361 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms