Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sall3Q62255 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sall3Q62255 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sall3Q62255 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms