Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox19Q62249 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox19Q62249 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms