Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema5aQ62217 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema5aQ62217 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms