Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctr9Q62018 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctr9Q62018 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctr9Q62018 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms