Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Npm1Q61937 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Npm1Q61937 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Npm1Q61937 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms