Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga7Q61738 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga7Q61738 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms