Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrxQ61687 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AtrxQ61687 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms