Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fscn1Q61553 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Fscn1Q61553 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Fscn1Q61553 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Fscn1Q61553 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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Fscn1Q61553 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fscn1Q61553 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fscn1Q61553 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms