Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EsrrbQ61539 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EsrrbQ61539 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms