Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Erbb3Q61526 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Erbb3Q61526 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms