Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd53Q61451 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd53Q61451 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms