Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vsx2Q61412 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsx2Q61412 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsx2Q61412 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms