Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ift88Q61371 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ift88Q61371 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift88Q61371 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms