Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnna2Q61301 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnna2Q61301 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms