Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf12Q61286 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tcf12Q61286 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf12Q61286 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms