Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a1Q61165 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a1Q61165 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms