Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb3Q61087 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamb3Q61087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamb3Q61087 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms