Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp17laQ61068 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp17laQ61068 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp17laQ61068 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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