Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd3Q61060 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd3Q61060 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms