Protein–RNA interactions for Protein: Q61037

Tsc2, Tuberin, mousemouse

Predictions only

Length 1,814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc2Q61037 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Tsc2Q61037 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tsc2Q61037 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsc2Q61037 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsc2Q61037 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms