Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp7Q60973 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp7Q60973 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms