Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Neurod1Q60867 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Neurod1Q60867 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms