Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppp1r1bQ60829 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r1bQ60829 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r1bQ60829 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms