Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Klf4Q60793 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klf4Q60793 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms