Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atf3Q60765 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf3Q60765 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf3Q60765 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf3Q60765 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf3Q60765 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf3Q60765 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf3Q60765 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf3Q60765 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf3Q60765 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Atf3Q60765 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atf3Q60765 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Atf3Q60765 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf3Q60765 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf3Q60765 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf3Q60765 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atf3Q60765 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atf3Q60765 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Atf3Q60765 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atf3Q60765 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf3Q60765 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms