Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Samhd1Q60710 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samhd1Q60710 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms