Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxd4Q60688 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxd4Q60688 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms