Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgaeQ60677 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ItgaeQ60677 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgaeQ60677 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms