Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2aQ60648 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2aQ60648 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms