Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr2f1Q60632 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr2f1Q60632 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms