Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CttnQ60598 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CttnQ60598 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms