Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf123Q5XPI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf123Q5XPI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf123Q5XPI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms