Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp13a3Q5XF89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp13a3Q5XF89 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms