Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tdrd5Q5VCS6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms