Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncoa4Q5U4H9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncoa4Q5U4H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ncoa4Q5U4H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms