Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdcp1Q5U462 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms