Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsr1Q5SWD9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsr1Q5SWD9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms