Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc42Q5SV66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc42Q5SV66 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms